Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms