Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA3EQ6PEY2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms