Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.264e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.74e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.724e-15■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 WRAP53-205ENST00000463804 504 ntTSL 310.35□□□□□ -0.754e-8■■■■■ 30.4
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PRPF8Q6P2Q9 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 30.4
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