Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RTL6Q6ICC9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RTL6Q6ICC9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RTL6Q6ICC9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RTL6Q6ICC9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RTL6Q6ICC9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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RTL6Q6ICC9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RTL6Q6ICC9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RTL6Q6ICC9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RTL6Q6ICC9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RTL6Q6ICC9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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RTL6Q6ICC9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RTL6Q6ICC9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RTL6Q6ICC9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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