Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMB2

TTLL5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL5Q6EMB2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTLL5Q6EMB2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms