Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BROXQ5VW32 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms