Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRIF1Q5T3J3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms