Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP188Q5SRE5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP188Q5SRE5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms