Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms