Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SDK2Q58EX2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SDK2Q58EX2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms