Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EIPR1Q53HC9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms