Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TPRNQ4KMQ1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPRNQ4KMQ1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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