Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms