Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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