Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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