Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFA9Q16795 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms