Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIST3H3Q16695 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms