Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CTF1Q16619 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CTF1Q16619 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CTF1Q16619 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CTF1Q16619 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTF1Q16619 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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