Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ECM1Q16610 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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