Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC18A3Q16572 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC18A3Q16572 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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