Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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SNAPC1Q16533 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SNAPC1Q16533 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SNAPC1Q16533 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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SNAPC1Q16533 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SNAPC1Q16533 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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SNAPC1Q16533 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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SNAPC1Q16533 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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