Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms