Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms