Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms