Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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