Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TTF1Q15361 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TTF1Q15361 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TTF1Q15361 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TTF1Q15361 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTF1Q15361 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTF1Q15361 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TTF1Q15361 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TTF1Q15361 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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