Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKX1-1Q15270 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX1-1Q15270 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms