Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK1Q15118 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms