Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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HERPUD1Q15011 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HERPUD1Q15011 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERPUD1Q15011 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERPUD1Q15011 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERPUD1Q15011 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERPUD1Q15011 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERPUD1Q15011 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERPUD1Q15011 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERPUD1Q15011 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERPUD1Q15011 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HERPUD1Q15011 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HERPUD1Q15011 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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