Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHPRHQ149N8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHPRHQ149N8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
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