Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF235Q14590 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms