Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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GBX1Q14549 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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GBX1Q14549 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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GBX1Q14549 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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GBX1Q14549 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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GBX1Q14549 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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GBX1Q14549 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GBX1Q14549 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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