Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
BECN1Q14457 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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BECN1Q14457 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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BECN1Q14457 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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BECN1Q14457 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BECN1Q14457 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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