Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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