Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM29Q14134 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms