Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK13Q14004 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms