Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PDE6HQ13956 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms