Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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CUL4AQ13619 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CUL4AQ13619 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CUL4AQ13619 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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