Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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