Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATMQ13315 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATMQ13315 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATMQ13315 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATMQ13315 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATMQ13315 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATMQ13315 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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