Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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