Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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ERCC8Q13216 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ERCC8Q13216 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ERCC8Q13216 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ERCC8Q13216 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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ERCC8Q13216 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERCC8Q13216 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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