Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPA4Q13156 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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