Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF2Q12933 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms