Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NFIAQ12857 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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