Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
STX4Q12846 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
STX4Q12846 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
STX4Q12846 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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STX4Q12846 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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STX4Q12846 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
STX4Q12846 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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