Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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