Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMAGPQ0VAQ4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms