Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACSM1Q08AH1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms