Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSRP1Q08945 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms